基础医学系成立于2015年10月，秉承于1987年毕节医学高等专科学校前身“毕节市卫生学校”的疾病学基础教研室、解剖教研室和化学教研组整合而成，始建于1958年，是我校医学基础教学部门。通过三年学习，按教学计划学完全部课程，经考核成绩合格，颁发毕节医学高等专科学校专科毕业证书。在校期间参加职业技能鉴定考核，可获得人社部颁发的医药商品购销员、西药药剂员、药物制剂工和药物检验工资格证书;毕业后获得药学专业大学专科毕业证书。
主要课程
无机化学、有机化学、分析化学、天然药物学、天然药物化学、药物化学、药剂学、药物分析、药理学、药事管理与法规、药品市场营销、、医药商品学、药品质量管理、临床医学概论、临床药物治疗学、药品储存与养护、新药研究与申报等课程。
招生要求1、五官：端正，无明显的斜视、斜颈、面部畸形、大片色素沉着、疤痕、血管瘤等。
2、无药物过敏史、既往病史、家族遗传病等。
3、由于医疗卫生服务工作的特殊性，学校不予录取色弱、色盲等不符合报考医学类专业的考生;患有一眼矫正到4.8镜片度数大于800度、两耳听力均在3米以内、患有失明、斜视、弱视、嗅觉迟钝、口吃者、肢体残疾、脑瘫等以上疾病不宜报考医学类专业。
培养目标培养掌握药品生产、药品质量分析检验、药品使用、医药企业经营管理等方面的基本理论知识、基本知识与基本技能，具有良好的职业道德、人文素养、实践能力和创新精神，毕业后能在医院(乡镇卫生院)药房、医药公司、制药企业、社会药房等单位从事药品生产、经营、药学服务等工作，也能够在药品检验监督部门从事药品检验监督管理，在药物研究机构、医药院校从事医药科研助理、教学辅助等工作的高素质应用型药学专业人才。
就业方向主要就业于医院药剂科，从事面向药品生产企业，从事药品调剂、用药咨询、临床用药指导、药库管理、静脉配置、药物制剂及检验等;药品生产企业从事药品生产、质量控制、生产管理等;食品药品检验所从事药品检测、新药研发等;药品经营企业从事药品营销、药品质量管理、药品售后服务等。
药学专业小知识复方麝香注射液：豁痰开窍、醒脑安神。用于痰热内闭所致的中风昏迷。
醒脑静注射液：清热解毒，凉血活血，开窍醒脑。
硝酸甘油注射液：用于冠心病心绞痛的治疗及预防，也可用于降低血压或治疗充血性心力衰竭。
环磷腺苷葡胺注射液：用于心力衰竭、心肌炎、病窦综合征、冠心病及心肌病，也可用于心律失常的辅助治疗。
盐酸异丙肾上腺素注射液：①治疗心源性或感染性休克②治疗完全性房室传导阻滞、心搏骤停。
盐酸洛贝林注射液：用于各种原因引起的中枢性呼吸抑制。
